Sequenzierplattform für humane Genom- und Transkriptomsequenzierungen

Beschafft wird eine technologieneutral ausgeschriebene Hochdurchsatz-Sequenzierplattform zur humanen Ganzgenom- und Transkriptomsequenzierung im Rahmen der molekularpathologischen Diagnostik am Institut für Pathologie der Universität Regensburg.

Gegenstand des Auftrags sind das Sequenziersystem als Kauf, ein dreijähriger Wartungs- und Servicevertrag sowie eine Rahmenvereinbarung über Reagenzien und Verbrauchsmaterialien für drei Jahre zu einem gebundenen Festpreis je Kit oder Reaktion.

Das System muss für Blut, Frischgewebe und Paraffingewebe geeignet sein und auch bei kleinen Gewebeproben mit limitierter DNA- und RNA-Menge die Mindestanforderungen erfüllen.

Für die humane Ganzgenomsequenzierung sind eine Zielcoverage von mindestens 100x für Tumorgewebe und mindestens 30x für Keimbahn- oder Normalgewebe bei einer durchschnittlichen Basengenauigkeit von mindestens 99,90 Prozent vorgeschrieben.

Die humane Ganztranskriptomsequenzierung erfordert mindestens 50 Millionen Reads bei einem Input von 100 ng RNA, wobei diese Werte auch für FFPE-Gewebe gelten müssen.

Die Anlage muss für ein Jahresvolumen von 100 bis 300 Sequenzierungen ausgelegt sein und eine Skalierbarkeit auf perspektivisch mindestens 600 onkologische Fälle pro Jahr mit doppelter Zielcoverage ermöglichen.

Die Betreibbarkeit als in-house-validiertes Verfahren unter den Bedingungen einer Akkreditierung nach DIN EN ISO 15189 ist zwingend erforderlich.

Der Bieter muss mindestens zwei Referenzinstallationen der angebotenen Plattform in nach DIN EN ISO 15189 oder gleichwertig akkreditierten Fachlaboren im EWR nachweisen, die in der vertragsärztlichen Patientenversorgung tätig sind.